RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 RAD51CO43502 376 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 ITGA8P53708 1063 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 POU4F1Q01851 419 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 TMEM62Q0P6H9 643 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 FUT11Q495W5 492 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 71
RXRA-201ENST00000356384 ECSITQ9BQ95 431 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 TPST1O60507 370 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 DGAT1O75907 488 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 DLGAP3O95886 979 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 PDK1Q15118 436 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SGF29Q96ES7 293 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 MTA3Q9BTC8 594 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 CFAP99D6REC4 459 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 PDIA5Q14554 519 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SNX17Q15036 470 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 BATF3Q9NR55 127 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SRGNP10124 158 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 XKR3Q5GH77 459 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 HEATR9A2RTY3 570 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 MYBP10242 640 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 COMTP21964 271 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 MTMR2Q13614 643 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 TP53BP2Q13625 1128 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 ALX1Q15699 326 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 MGAT5BQ3V5L5 792 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 BRINP3Q76B58 766 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 NSL1Q96IY1 281 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.74■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 USP1O94782 785 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 FDX1P10109 184 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 PLIN5Q00G26 463 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 DCAF6Q58WW2 860 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 NEDD1Q8NHV4 660 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 UBA3Q8TBC4 463 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 JADE3Q92613 823 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 TIPINQ9BVW5 301 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 RAD18Q9NS91 495 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 RGS5O15539 181 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SOX13Q9UN79 622 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 CST8O60676 142 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 BRD2P25440 801 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 PSMA3P25788 255 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 PTK6Q13882 451 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 PPCSQ9HAB8 311 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 NARFQ9UHQ1 456 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 A0A1B0GTH6 734 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SPAG6O75602 509 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 LSP1P33241 339 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 KCNJ6P48051 423 aa16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 CHRNA5P30532 468 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 RERGLQ9H628 205 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 PRIM2P49643 509 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 NUDT2P50583 147 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 PRKCQQ04759 706 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 ZNF786Q8N393 782 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 FAM71DQ8N9W8 422 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 KCNH4Q9UQ05 1017 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 PTCH1Q13635 1447 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 KCNJ1P48048 391 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 RFX3P48380 749 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 NAB2Q15742 525 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 FAM117BQ6P1L5 589 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 STKLD1Q8NE28 680 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 RAET1EQ8TD07 263 aa16.72■□□□□ 0.27
RXRA-201ENST00000356384 TRIM66O15016 1216 aa16.72■□□□□ 0.27
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