RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX27Q96L92 541 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 APOL6Q9BWW8 343 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 ACP6Q9NPH0 428 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 CNTN3Q9P232 1028 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF14Q9UBS8 474 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1257Q9ULG3 409 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX12Q9UMY4 172 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 HYOU1Q9Y4L1 999 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 SQORQ9Y6N5 450 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 KAT6AQ92794 2004 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-201ENST00000319942 GRIN2DO15399 1336 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 EVPLQ92817 2033 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CTAGE15A4D2H0 777 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 RECQL4O94761 1208 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PAEPP09466 180 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CTAGE8P0CG41 777 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNE1P15382 129 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 AKAP5P24588 427 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CTHP32929 405 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PAFAH1B1P43034 410 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ASPAP45381 313 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 HADHBP55084 474 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 AMPD2Q01433 879 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS6KA1Q15418 735 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB6Q15916 424 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 UBXN11Q5T124 520 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 LIN9Q5TKA1 542 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX26Q7Z412 305 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CTAGE6Q86UF2 777 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CTAGE4Q8IX94 777 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 UBR7Q8N806 425 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 OLIG1Q8TAK6 271 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 VCPIP1Q96JH7 1222 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MMS19Q96T76 1030 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 BCO2Q9BYV7 579 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 THAP2Q9H0W7 228 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 STARD7Q9NQZ5 370 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R14Q9NYV8 317 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 HES2Q9Y543 173 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 IPPQ9Y573 584 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP83Q9Y592 693 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 UMODL1Q5DID0 1318 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 LSM8O95777 96 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP1A2P05177 515 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SKIP12755 728 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 UNGP13051 313 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGA4P13612 1032 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PNPLA4P41247 253 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB27AP51159 221 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF132P52740 706 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PAK2Q13177 524 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 XKR4Q5GH76 650 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO47Q5MNV8 452 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 DAAM2Q86T65 1068 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PALB2Q86YC2 1186 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf38Q8TB03 319 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CAGE1Q8TC20 777 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PBKQ96KB5 322 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SELENOOQ9BVL4 669 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 TLR10Q9BXR5 811 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 UVRAGQ9P2Y5 699 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 GTF3C4Q9UKN8 822 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 AMFRQ9UKV5 643 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PADI3Q9ULW8 664 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 NCANO14594 1321 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 GRID2IPA4D2P6 1211 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 TTLL8A6PVC2 850 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF623O75123 536 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CD19P15391 556 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP221Q4G0U5 840 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF394Q53GI3 561 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM26DQ5JW98 314 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC181Q5TID7 509 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SCARA3Q6AZY7 606 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SLFN11Q7Z7L1 901 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAAF5Q86Y56 855 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MCOLN2Q8IZK6 566 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC57Q8N9N7 239 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM35BQ8NCS4 154 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 WHAMMQ8TF30 809 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CPA5Q8WXQ8 436 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms