RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.56■□□□□ 0.88
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SYTL1-201ENST00000318074 VDRP11473 427 aa20.55■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 CHRNB2P17787 502 aa20.55■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 FMO1Q01740 532 aa20.55■□□□□ 0.88
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SYTL1-201ENST00000318074 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.55■□□□□ 0.88
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SYTL1-201ENST00000318074 C12orf29Q8N999 325 aa20.54■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.54■□□□□ 0.88
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SYTL1-201ENST00000318074 SYN3O14994 580 aa20.53■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 CCP110O43303 1012 aa20.53■□□□□ 0.88
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SYTL1-201ENST00000318074 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.53■□□□□ 0.88
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SYTL1-201ENST00000318074 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.53■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 KIAA1328Q86T90 577 aa20.53■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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SYTL1-201ENST00000318074 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.53■□□□□ 0.88
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SYTL1-201ENST00000318074 STILQ15468 1287 aa20.52■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 CNGA2Q16280 664 aa20.52■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.52■□□□□ 0.88
SYTL1-201ENST00000318074 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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SYTL1-201ENST00000318074 CFHP08603 1231 aa20.51■□□□□ 0.87
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SYTL1-201ENST00000318074 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.51■□□□□ 0.87
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SYTL1-201ENST00000318074 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
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SYTL1-201ENST00000318074 OAZ2O95190 189 aa20.51■□□□□ 0.87
SYTL1-201ENST00000318074 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYTL1-201ENST00000318074 SYT15Q9BQS2 421 aa20.51■□□□□ 0.87
SYTL1-201ENST00000318074 SPG21Q9NZD8 308 aa20.51■□□□□ 0.87
SYTL1-201ENST00000318074 ATP2C2O75185 946 aa20.5■□□□□ 0.87
SYTL1-201ENST00000318074 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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SYTL1-201ENST00000318074 FGFR3P22607 806 aa20.5■□□□□ 0.87
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