RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 PCDHB8Q9UN66 801 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 INSL6Q9Y581 213 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 HCRTO43612 131 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 LCA5LO95447 670 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 TYMPP19971 482 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 BRD2P25440 801 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 CYP27A1Q02318 531 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ACOT1Q86TX2 421 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 SPATA18Q8TC71 538 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1257Q9ULG3 409 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ZNF263O14978 683 aa23.56■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 VDRP11473 427 aa23.56■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 KRT83P78385 493 aa23.56■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.56■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 TFAP2BQ92481 460 aa23.56■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 NAGPAQ9UK23 515 aa23.56■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 RASIP1Q5U651 963 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 FUT10Q6P4F1 479 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 TNIP3Q96KP6 325 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ZNF558Q96NG5 402 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.367e-9■■■■■ 35.7
CTU2-201ENST00000312060 MED7O43513 233 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 CCDC175P0C221 793 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 LAG3P18627 525 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 SGO2Q562F6 1265 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 FIBCD1Q8N539 461 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 C12orf29Q8N999 325 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 PCDHB18PQ96TA0 734 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 RAD9AQ99638 391 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 CARNS1A5YM72 827 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 SYN3O14994 580 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 TLL1O43897 1013 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 PALB2Q86YC2 1186 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 IGSF21Q96ID5 467 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 CFHP08603 1231 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 PCSK1P29120 753 aa23.53■■□□□ 1.36
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CTU2-201ENST00000312060 MAGEA1P43355 309 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 CNGA2Q16280 664 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 CEP57Q86XR8 500 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ZSCAN12O43309 604 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ACBD6Q9BR61 282 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 AAASQ9NRG9 546 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 CDH9Q9ULB4 789 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 NENFQ9UMX5 172 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 GBF1Q92538 1859 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 O00370 1275 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 ATP2C2O75185 946 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 GZMAP12544 262 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 SHHQ15465 462 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 STILQ15468 1287 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 TRIM72Q6ZMU5 477 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 PASD1Q8IV76 773 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 RTP3Q9BQQ7 232 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 SYT15Q9BQS2 421 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 OAZ2O95190 189 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-201ENST00000312060 FGFR3P22607 806 aa23.51■■□□□ 1.35
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