RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP83Q9Y592 693 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 NME7Q9Y5B8 376 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD62A6NC57 917 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 DGKIO75912 1065 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 CFHP08603 1231 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 BRCC3P46736 316 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ACOT1Q86TX2 421 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 BADQ92934 168 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TOP1MTQ969P6 601 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TNIP3Q96KP6 325 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 DSEQ9UL01 958 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 M0QZQ0 153 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TUBB4AP04350 444 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGB1P05556 798 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 LHX1P48742 406 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 NOMO3P69849 1222 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 CENPCQ03188 943 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 NAA35Q5VZE5 725 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA18Q8TC71 538 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 SUSD3Q96L08 255 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 I3L4J1 428 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 GABRDO14764 452 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 PDGFRBP09619 1106 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM253P0C7T8 217 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 TNNT1P13805 278 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCB4P21439 1286 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 LMO2P25791 158 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 DEFB103AP81534 67 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 STILQ15468 1287 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM170AA1A519 330 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 F8W810 466 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 O00370 1275 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ALDH2P05091 517 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 GNG11P61952 73 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CNGA2Q16280 664 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 OSTM1Q86WC4 334 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 METTL23Q86XA0 190 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 C12orf29Q8N999 325 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 NRP1O14786 923 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 HCRTO43612 131 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAPPC3O43617 180 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP11A1P05108 521 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 THAP2Q9H0W7 228 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 LHX5Q9H2C1 402 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 COL4A6Q14031 1691 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TADA2AO75478 443 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 FGBP02675 491 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM11Q96F44 468 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 HCSTQ9UBK5 93 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHB8Q9UN66 801 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 M0QYV0 167 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 MICAL2O94851 1124 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC11A1P49279 550 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 NOX5Q96PH1 765 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 NCANO14594 1321 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBBXA8MT70 800 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TYMPP19971 482 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 PCSK1P29120 753 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-201ENST00000298838 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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