RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
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TRIM54-201ENST00000296098 KRT10P13645 584 aa25.32■■□□□ 1.64
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TRIM54-201ENST00000296098 NLRP7Q8WX94 980 aa25.3■■□□□ 1.64
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.3■■□□□ 1.64
TRIM54-201ENST00000296098 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TRIM54-201ENST00000296098 CYTH4Q9UIA0 394 aa25.3■■□□□ 1.64
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TRIM54-201ENST00000296098 STRNO43815 780 aa25.3■■□□□ 1.64
TRIM54-201ENST00000296098 ACSL3O95573 720 aa25.3■■□□□ 1.64
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TRIM54-201ENST00000296098 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.29■■□□□ 1.64
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TRIM54-201ENST00000296098 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.29■■□□□ 1.64
TRIM54-201ENST00000296098 FAM169AQ9Y6X4 670 aa25.29■■□□□ 1.64
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