RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 ARID3AQ99856 593 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SNX25Q9H3E2 840 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CDH9Q9ULB4 789 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MYH10P35580 1976 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 WDR27A2RRH5 827 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PER2O15055 1255 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 NCK2O43639 380 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CILPO75339 1184 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ABLIM3O94929 683 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 GLUD1P00367 558 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 RFX1P22670 979 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 LMO2P25791 158 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TSPY1Q01534 308 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SMARCB1Q12824 385 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 GPR17Q13304 367 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 NR1I3Q14994 352 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TPGS2Q68CL5 300 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 EFHBQ8N7U6 833 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM209Q96SK2 561 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SYT15Q9BQS2 421 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 RBSNQ9H1K0 784 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CISHQ9NSE2 258 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PQC6 194 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 A8MXQ7 604 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TEX33O43247 280 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TGM5O43548 720 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 HCRTO43612 131 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 OR4Q2P0C623 313 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CPB1P15086 417 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 NDST1P52848 882 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SYCP1Q15431 976 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 FAM171BQ6P995 826 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 RRAGAQ7L523 313 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 WHAMMQ8TF30 809 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 KAT5Q92993 513 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TNIP3Q96KP6 325 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MAFFQ9ULX9 164 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 VNN2O95498 520 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 GLP2RO95838 553 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PDGFRBP09619 1106 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ATF2P15336 505 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CD58P19256 250 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MFAP3P55082 362 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 UBASH3AP57075 661 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 APBA1Q02410 837 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PALB2Q86YC2 1186 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CASP10Q92851 521 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 TWNKQ96RR1 684 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 GANQ9H2C0 597 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.11□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 MTMR11A4FU01 709 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ATP2C2O75185 946 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 NOL4O94818 638 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 UCHL3P15374 230 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 EPCAMP16422 314 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 KLK7P49862 253 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ARPP19P56211 112 aa14.1□□□□□ -0.15
CCDC42-201ENST00000293845 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms