RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.16■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.16■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 C4orf22Q6V702 233 aa21.16■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 CXorf38Q8TB03 319 aa21.16■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 POLBP06746 335 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 WDCPQ9H6R7 721 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 H0Y3Z8 333 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 CYB561D2O14569 222 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 ACOT1Q86TX2 421 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 ITSN1Q15811 1721 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 CDH18Q13634 790 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 CGRRF1Q99675 332 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 PPCSQ9HAB8 311 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 MTBPQ96DY7 904 aa21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 PYGLP06737 847 aa21.14■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 PON1P27169 355 aa21.14■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 GPC2Q8N158 579 aa21.14■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.14■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.14■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 ADCK2Q7Z695 626 aa21.14■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.14■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
USP25-202ENST00000285681 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 STRNO43815 780 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 THP07101 528 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 FBXW4P57775 412 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 PGM5Q15124 567 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 A0A087WZ62 844 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 CASP4P49662 377 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 RGS4P49798 205 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 TRIML2Q8N7C3 387 aa21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 H0Y626 953 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 PTGER2P43116 358 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 TEKT4Q8WW24 435 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 VWA5AO00534 786 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 TMC2Q8TDI7 906 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 CPB2Q96IY4 423 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 THAP2Q9H0W7 228 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 RRAGCQ9HB90 399 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 NWD1Q149M9 1564 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.13■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 CHUKO15111 745 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 CASP7P55210 303 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 DACT2Q5SW24 774 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 FBXO32Q969P5 355 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 FAM161BQ96MY7 647 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 IDI2Q9BXS1 227 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 TASP1Q9H6P5 420 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 PKP3Q9Y446 797 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 EGFRP00533 1210 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 SERPIND1P05546 499 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 KCNJ1P48048 391 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 ORC1Q13415 861 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 LONRF1Q17RB8 773 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 ING2Q9H160 280 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 ETNK1Q9HBU6 452 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 F9P00740 461 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 KRT4P19013 534 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.12■□□□□ 0.97
USP25-202ENST00000285681 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms