RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 RNF135Q8IUD6 432 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 MREGQ8N565 214 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SPDL1Q96EA4 605 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TNIP3Q96KP6 325 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 HIF1AQ16665 826 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 STOML1Q9UBI4 398 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SCOCQ9UIL1 159 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TRAPPC3O43617 180 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PRKCIP41743 596 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 MAGEA4P43358 317 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 EFHC2Q5JST6 749 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 HGSNATQ68CP4 663 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SERPINB12Q96P63 405 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.819e-7■■■■■ 31.6
ANKRD40-201ENST00000285243 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PDHXO00330 501 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SENP1Q9P0U3 644 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GMNNO75496 209 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PSMD10O75832 226 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 AKAP5P24588 427 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PMLP29590 882 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ARFIP2P53365 341 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 CYP24A1Q07973 514 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 DNAJC3Q13217 504 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 METTL7BQ6UX53 244 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 CD302Q8IX05 232 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF560Q96MR9 790 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 DNAJC18Q9H819 358 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 DFFAO00273 331 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GRIK1P39086 918 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 POU5F1BQ06416 359 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 BBS5Q8N3I7 341 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 YIPF3Q9GZM5 350 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 CISHQ9NSE2 258 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 USH1CQ9Y6N9 552 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 NAMPTP43490 491 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 CYTH2Q99418 400 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 CFLARO15519 480 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 STAG3L1P0CL83 205 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 AP3M2P53677 418 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SPATA24Q86W54 205 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GZMAP12544 262 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ARHGEF6Q15052 776 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SHISA4Q96DD7 197 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 MAP3K7O43318 606 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GRIN3BO60391 1043 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 FSBPO95073 299 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 THPOP40225 353 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 CASP2P42575 452 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 HES2Q9Y543 173 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 C2CD2LO14523 706 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 ADORA2AP29274 412 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 OR1G1P47890 313 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 COPS2P61201 443 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD40-201ENST00000285243 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms