RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 SUN2Q9UH99 717 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TMX2Q9Y320 296 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SPAG6O75602 509 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 EMC1Q8N766 993 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 GANQ9H2C0 597 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MUTP22033 750 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ATP6V1G2O95670 118 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CHEK2O96017 543 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SHBGP04278 402 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PGM2Q96G03 612 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 AIM2O14862 343 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CAP2P40123 477 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CYP24A1Q07973 514 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CYTH1Q15438 398 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TTC8Q8TAM2 541 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CHST7Q9NS84 486 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 GSTA4O15217 222 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.238e-7■■■■□ 19.5
USP12-201ENST00000282344 MICALL2Q8IY33 904 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 DNAJC18Q9H819 358 aa22.72■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ZBTB7AO95365 584 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PPATQ06203 517 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MYBPC2Q14324 1141 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CNGA3Q16281 694 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 EXD1Q8NHP7 514 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TMC2Q8TDI7 906 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MED15Q96RN5 788 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PAFAH2Q99487 392 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 GPD1P21695 349 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SERPINB9P50453 376 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 RHBDL3P58872 404 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 O00370 1275 aa22.71■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SERPINB4P48594 390 aa22.7■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 GARTP22102 1010 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 PPP3CAQ08209 521 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 ZBBXA8MT70 800 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 ADCY3O60266 1144 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 RPS6KA5O75582 802 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 FSBPO95073 299 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 OLFM3Q96PB7 478 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 MMP19Q99542 508 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 KRT82Q9NSB4 513 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 PRAMEP78395 509 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 IQCKQ8N0W5 287 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 DCLK3Q9C098 648 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.7■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 ITGB3P05106 788 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 VHLP40337 213 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 MARCKSL1P49006 195 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 DLG4P78352 724 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 SMAPO00193 183 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 RFC5P40937 340 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 TPI1P60174 286 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 USP33Q8TEY7 942 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 GPRASP2Q96D09 838 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 GHRP10912 638 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 MYL2P10916 166 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 MREGQ8N565 214 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 RDM1Q8NG50 284 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 TNIP3Q96KP6 325 aa22.69■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 GJB6O95452 261 aa22.68■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
USP12-201ENST00000282344 SULT1E1P49888 294 aa22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms