RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC35F6Q8N357 371 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBR7Q8N806 425 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF558Q96NG5 402 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INTUQ9ULD6 942 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LILRA4P59901 499 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.7■■□□□ 1.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BTNL10A8MVZ5 291 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H2AFZP0C0S5 128 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHRNB2P17787 502 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LAG3P18627 525 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAF6P49848 677 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDR2Q01850 454 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H2AFVQ71UI9 128 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.69■■□□□ 1.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLIQ9UNA4 740 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GBF1Q92538 1859 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TADA2AO75478 443 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF677Q86XU0 584 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASPAP45381 313 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAP1Q03518 808 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYO1EQ12965 1108 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM270Q6UE05 265 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGSF21Q96ID5 467 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF560Q96MR9 790 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CERS4Q9HA82 394 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACP6Q9NPH0 428 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MSRAQ9UJ68 235 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KPNA7A9QM74 516 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TACC1O75410 805 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTNNB1P35222 781 aa21.67■■□□□ 1.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAF3Q5VWG9 929 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PALB2Q86YC2 1186 aa21.67■■□□□ 1.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 B3GALT6Q96L58 329 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTAGE9A4FU28 777 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MMEP08473 750 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GZMAP12544 262 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 P4HA1P13674 534 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAJB2P25686 324 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BMPR1AP36894 532 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNPLA4P41247 253 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF132P52740 706 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAB30Q15771 203 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SV2CQ496J9 727 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SENP8Q96LD8 212 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOX5Q96PH1 765 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCO2Q9BYV7 579 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AAASQ9NRG9 546 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CISHQ9NSE2 258 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPG21Q9NZD8 308 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDH23Q9H251 3354 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MOCS3O95396 460 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAP1GAPP47736 663 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TERF1P54274 439 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GALCP54803 685 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FUT10Q6P4F1 479 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MMS19Q96T76 1030 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ISCUQ9H1K1 167 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.66■■□□□ 1.06
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