RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 RHOT1Q8IXI2 618 aa18.26■□□□□ 0.51
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RABGGTA-201ENST00000216840 BEST2Q8NFU1 509 aa18.26■□□□□ 0.51
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RABGGTA-201ENST00000216840 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.26■□□□□ 0.51
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RABGGTA-201ENST00000216840 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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RABGGTA-201ENST00000216840 TJP2Q9UDY2 1190 aa18.25■□□□□ 0.51
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RABGGTA-201ENST00000216840 KATNAL2Q8IYT4 538 aa18.24■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 MREGQ8N565 214 aa18.24■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.24■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.24■□□□□ 0.51
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RABGGTA-201ENST00000216840 SEPT4O43236 478 aa18.24■□□□□ 0.51
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RABGGTA-201ENST00000216840 IPPQ9Y573 584 aa18.22■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 SIGLEC16A6NMB1 481 aa18.22■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 F8VP50 259 aa18.22■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.22■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 TCF4P15884 667 aa18.22■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 ALS2CLQ60I27 953 aa18.22■□□□□ 0.51
RABGGTA-201ENST00000216840 LCLAT1Q6UWP7 414 aa18.22■□□□□ 0.51
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