RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ALOX15BO15296 676 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ATP6V1G2O95670 118 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ETS1P14921 441 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 CDKN2BP42772 138 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 RIPK1Q13546 671 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 NEDD9Q14511 834 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 MTFR1Q15390 333 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ZNF394Q53GI3 561 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 WLSQ5T9L3 541 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 IER5Q5VY09 327 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ECT2Q9H8V3 914 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 PPCSQ9HAB8 311 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 LRRD1A4D1F6 860 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TAC1P20366 129 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 GCAP28676 217 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SLC18A1P54219 525 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SENP1Q9P0U3 644 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 GGT7Q9UJ14 662 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.89■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 NCALDP61601 193 aa21.88■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 PLCB3Q01970 1234 aa21.88■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ADCY1Q08828 1119 aa21.88■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 RNF43Q68DV7 783 aa21.88■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.88■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 CENPUQ71F23 418 aa21.88■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.88■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.88■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.88■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 LCTP09848 1927 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 PCGF5Q86SE9 256 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TCP11Q8WWU5 503 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 FAM167AQ96KS9 214 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 VPS37BQ9H9H4 285 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SGK1O00141 431 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 WEE2P0C1S8 567 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 FOXN2P32314 431 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 WDR4P57081 412 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ACVR2BQ13705 512 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TFAP2BQ92481 460 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 NOD2Q9HC29 1040 aa21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 MAGEB2O15479 319 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 PRKCBP05771 671 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TGFB3P10600 412 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 RASA2Q15283 850 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 MAPK6Q16659 721 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ZNF699Q32M78 642 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 CGB2Q6NT52 195 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 CEP57Q86XR8 500 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SLC35B2Q8TB61 432 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TRABDQ9H4I3 376 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ASMTLO95671 621 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 HAUS1Q96CS2 278 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.86■■□□□ 1.09
STRADB-201ENST00000194530 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms