RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 AGAP3Q96P47 875 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ERBB4Q15303 1308 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 HEATR9A2RTY3 570 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 POTEIP0CG38 1075 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 LIFRP42702 1097 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 POTEGQ6S5H5 508 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ZNF682O95780 498 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 CYP21A2P08686 494 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 AKAP5P24588 427 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 AP3B2Q13367 1082 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PTK6Q13882 451 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ZNF544Q6NX49 715 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 TTC3P53804 2025 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 CACNA1CQ13936 2221 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 TTC26A0AVF1 554 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 KYAT1Q16773 422 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PID1Q7Z2X4 250 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ADD2P35612 726 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 FAM160B2Q86V87 743 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.64□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PDE8BO95263 885 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 GUCY1A2P33402 732 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 TRIM32Q13049 653 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 STX5Q13190 355 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PCSK7Q16549 785 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 UTYO14607 1347 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ITIH2P19823 946 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 EPHX4Q8IUS5 362 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 MUC3BQ9H195 1237 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PIDD1Q9HB75 910 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 CLRN2A0PK11 232 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 GRIK1P39086 918 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 BCAP31P51572 246 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 CDC73Q6P1J9 531 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 RMDN3Q96TC7 470 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 RAD18Q9NS91 495 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 TPST1O60507 370 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 MED26O95402 600 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ATP6V1C1P21283 382 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 TGFBR2P37173 567 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 FUT11Q495W5 492 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 USP17L8P0C7I0 530 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 STX4Q12846 297 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 MTFR1Q15390 333 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 GREM2Q9H772 168 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 COPG2Q9UBF2 871 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 POTECB2RU33 542 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 STAT3P40763 770 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 SCTRP47872 440 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 PTGISQ16647 500 aa9.63□□□□□ -0.87
TNS1-201ENST00000171887 VAV3Q9UKW4 847 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms