RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055131.12

Usp48-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp48, Length 5,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mgea5Q9EQQ9 916 aa18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 Efcab12V9GXH0 673 aa18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 Bcat1P24288 386 aa18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hoxd10P28359 340 aa18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 Otub1Q7TQI3 271 aa18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 Lrrc1Q80VQ1 524 aa18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 Atg4cQ811C2 458 aa18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fbxo9Q8BK06 437 aa18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 Clca1Q9D7Z6 913 aa18.08■□□□□ 0.49
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zscan4dA7KBS4 506 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm8298J3QPI0 401 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Anxa8O35640 327 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 CrymO54983 313 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zscan4fQ3URS2 506 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Arhgef9Q3UTH8 516 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hspa1aQ61696 641 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Oca2Q62052 833 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Map3k10Q66L42 940 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zscan4cQ80VJ6 506 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Kcns3Q8BQZ8 491 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Oip5A2AQ14 241 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr726E9Q8X3 321 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Atf6F6VAN0 656 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr725Q05A45 321 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfm4Q3UZZ4 505 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 ChukQ60680 745 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ttc30a1Q99J38 664 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 MkksQ9JI70 570 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 PodxlQ9R0M4 503 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Abca8bQ8K440 1620 aa18.08■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fgl2P12804 432 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 OsbpQ3B7Z2 805 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ppm1nQ8BGL1 404 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Elmo3Q8BYZ7 720 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tldc1Q8K0P3 455 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zmat2Q9CPW7 199 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 SynrgQ5SV85 1306 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rap1gds1E9Q912 607 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc25a38Q91XD8 326 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Atpaf2Q91YY4 289 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 LactbQ9EP89 551 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 RasefQ5RI75 627 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 CttnQ60598 546 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tll1Q62381 1013 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zc4h2Q68FG0 224 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 S100pbpQ9D5K4 396 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cyp4f14Q9EP75 524 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gprc5dQ9JIL6 344 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tob2Q9JM55 345 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tspan3Q9QY33 253 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Akt1P31750 480 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cd86P42082 309 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cox18Q8VC74 331 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Trim12aQ99PQ1 284 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 MetP16056 1379 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ism1A2ATD1 454 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rbm46P86049 533 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Trpc1Q61056 793 aa18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm29554A0A087WNW4 188 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 4930469K13RikA0A286YDB2 92 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr8Q60892 310 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Q8K2W9 541 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ifi30Q9ESY9 248 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zbtb12Q9Z150 459 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rps6P62754 249 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 FAM120AQ6A0A9 1112 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Krt73Q6NXH9 539 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ahi1Q8K3E5 1047 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rev1Q920Q2 1249 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dpp3Q99KK7 738 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hmgxb3G3X9M3 1254 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pstpip1P97814 415 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tube1Q9D6T1 475 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 1700123K08RikQ9D991 295 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 2210016F16RikG3X8U3 338 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr698Q7TRN4 311 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Them6Q80ZW2 207 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Alg3Q8K2A8 438 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slf1Q8R3P9 1054 aa18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Serping1P97290 504 aa18.05■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 Klra5Q60652 266 aa18.05■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 PoliQ6R3M4 717 aa18.05■□□□□ 0.48
Usp48-201ENSMUST00000055131 SugctQ7TNE1 436 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.9 ms