RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm3636E9Q5P1 227 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AlbP07724 608 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mcpt4P21812 246 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mgat1P27808 447 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myl2P51667 166 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam210aQ8BGY7 273 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem62Q8BXJ9 643 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lmo3Q8BZL8 145 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q8CIL4 281 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trex1Q91XB0 314 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Wbp11Q923D5 641 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam136aQ9CR98 138 aa18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tbc1d25A1A5B6 742 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm13084A2A8N0 494 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgap45Q3TBD2 1116 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Map3k9Q3U1V8 1077 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc9b2Q5BKR2 547 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ugt1a1Q63886 535 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Foxb2Q64733 428 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Acap2Q6ZQK5 770 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tas2r134Q7TQB0 298 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 StambpQ9CQ26 424 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ggt5Q9Z2A9 573 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Robo3Q9Z2I4 1366 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgef37A1IGU4 676 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sh2d4bA6X942 431 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tlk2O55047 718 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ZfxP17012 799 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hoxa13Q62424 386 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam118bQ8C569 351 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc17Q8CE13 565 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Bhmt2Q91WS4 363 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Psmd6Q99JI4 389 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pds5aQ6A026 1332 aa18.11■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf804aA2AKY4 1200 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 EporP14753 507 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Krt19P19001 403 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem63bQ3TWI9 832 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tigd5Q499M4 642 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc169Q8BXX9 214 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cep57Q8CEE0 500 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Panx3Q8CEG0 392 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pdia5Q921X9 517 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc70Q9D9B0 223 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atp5hQ9DCX2 161 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm3182K7N6T8 263 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kcnn2P58390 839 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pcif1P59114 706 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pid1Q3UBG2 217 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem102Q3UPR7 509 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kcna4Q61423 654 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chsy1Q6ZQ11 800 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PaoxQ8C0L6 504 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dync1li1Q8R1Q8 523 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Plekhh3Q8VCE9 796 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr1502Q8VG66 316 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dqx1Q924H9 718 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pls3Q99K51 630 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sytl1Q99N80 567 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc5a5Q99PN0 618 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Katnal2Q9D3R6 539 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nacc2Q9DCM7 586 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vav3Q9R0C8 847 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Spata31d1aE9QA35 1336 aa18.1■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mmrn2A6H6E2 943 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Krt36B1AQ75 473 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prdm15E9Q8T2 1174 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ap1g1P22892 822 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Meis2P97367 477 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q3TTJ4 293 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Itih3Q61704 889 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sema4aQ62178 760 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znf426Q8R1D1 550 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 GsdmcQ99NB5 468 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Iqcf1Q9D9K8 182 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hao2Q9NYQ2 353 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Krt16Q9Z2K1 469 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nmt1O70310 496 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdh5P55284 784 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klrg2Q3UM83 387 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gata6Q61169 589 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nqo1Q64669 274 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q8BGA7 448 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CherpQ8CGZ0 936 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Borcs5Q9D920 195 aa18.09■□□□□ 0.49
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Bpifa3Q9D9J8 232 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.6 ms