RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640077.1

MED17-223, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 5

Gene MED17, Length 2,210 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-223	ENST00000640077	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CTAGE5	O15320	804 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	GPR32	O75388	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ABLIM3	O94929	683 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	REC8	O95072	547 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077		A0A1B0GUL7	405 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PCSK1	P29120	753 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CYP2C19	P33261	490 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	EPHB1	P54762	984 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SYCP1	Q15431	976 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MIER2	Q8N344	545 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ADGRB1	O14514	1584 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TPM3	P06753	285 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	DDC	P20711	480 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CTXN1	P60606	82 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	GGN	Q86UU5	652 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MYO1C	O00159	1063 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	COQ9	O75208	318 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	C1S	P09871	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ATP5J	P18859	108 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	FPR1	P21462	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	AKAP5	P24588	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	RAP2A	P10114	183 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	MAP2K2	P36507	400 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	RAB39A	Q14964	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MED17-223	ENST00000640077	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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