RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 SLC1A1P43005 524 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ARSEP51690 589 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 GPS1Q13098 491 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ARMC3Q5W041 872 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 SKA1Q96BD8 255 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 TMEM206Q9H813 350 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 KCNK13Q9HB14 408 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 CFHP08603 1231 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ZNF398Q8TD17 642 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 MCUR1Q96AQ8 359 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 CCDC17Q96LX7 622 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 TTC25Q96NG3 672 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 SYNCQ9H7C4 482 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.62■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 CLUHO75153 1309 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 TMEM150BA6NC51 233 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 LIASO43766 372 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 GSTA2P09210 222 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 CPA2P48052 419 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 MTM1Q13496 603 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 NSL1Q96IY1 281 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ZWINTO95229 277 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ZCCHC18P0CG32 403 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 VPS52Q8N1B4 723 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 NT5C1BQ96P26 610 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ARMCX1Q9P291 453 aa21.61■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 GPC3P51654 580 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PTP4A2Q12974 167 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 KRT39Q6A163 491 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 FBXO27Q8NI29 283 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 HAUS1Q96CS2 278 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 FOXP3Q9BZS1 431 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PMM2O15305 246 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 SLC16A4O15374 487 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 MMP10P09238 476 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 SSTR1P30872 391 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 JAG1P78504 1218 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 TFDP1Q14186 410 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 EFHC2Q5JST6 749 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 STMN2Q93045 179 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ZNF148Q9UQR1 794 aa21.6■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PSTPIP1O43586 416 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PASD1Q8IV76 773 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 MZB1Q8WU39 189 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 OCEL1Q9H607 264 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ALOX15BO15296 676 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 MAP3K7O43318 606 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PYGLP06737 847 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 CUL3Q13618 768 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 OGFOD1Q8N543 542 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 CFAP61Q8NHU2 1237 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 AZIN2Q96A70 460 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 MANSC1Q9H8J5 431 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 RAB20Q9NX57 234 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 GLRA2P23416 452 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 ARFIP2P53365 341 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 CDK16Q00536 496 aa21.58■■□□□ 1.05
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D25Q3MII6 688 aa21.58■■□□□ 1.05
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