RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624		H0YGN5	161 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	AIM2	O14862	343 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	STRN	O43815	780 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	GMNN	O75496	209 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	SLURP2	P0DP57	97 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	MTMR2	Q13614	643 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ADA2	Q9NZK5	511 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	NFS1	Q9Y697	457 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ABL2	P42684	1182 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	AP1B1	Q10567	949 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	PTK7	Q13308	1070 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	STK24	Q9Y6E0	443 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	STAM2	O75886	525 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ATP1A4	Q13733	1029 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TRIM11	Q96F44	468 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CHST7	Q9NS84	486 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624		A6NJR5	290 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CYP11B2	P19099	503 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	VAMP7	P51809	220 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CHI3L2	Q15782	390 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CCDC14	Q49A88	953 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	PALMD	Q9NP74	551 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	SAR1A	Q9NR31	198 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CHKB	Q9Y259	395 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ECE2	O60344	883 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D12	O60347	775 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	KRT38	O76015	456 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	HSPA4L	O95757	839 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	AQP5	P55064	265 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	LZIC	Q8WZA0	190 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	SCYL1	Q96KG9	808 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	LCA5L	O95447	670 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	BMP3	P12645	472 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	STX3	Q13277	289 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ZNF394	Q53GI3	561 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	FAF2	Q96CS3	445 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	HES6	Q96HZ4	224 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	DNAJC18	Q9H819	358 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	GPC4	O75487	556 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	MLH1	P40692	756 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	RTP1	P59025	263 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	BPIFB4	P59827	614 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	KLRC3	Q07444	240 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	GSTA3	Q16772	222 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CASP10	Q92851	521 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	E2F7	Q96AV8	911 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	CCDC138	Q96M89	665 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PXN-222	ENST00000637624	PNMA5	Q96PV4	448 aa		12.73	□□□□□ -0.37

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