RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 FAM170AA1A519 330 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 PLSCR1O15162 318 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 DNAJC6O75061 913 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 HLA-DRAP01903 254 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 MMP10P09238 476 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 FGFR1P11362 822 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 GM2AP17900 193 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 ALDH3A1P30838 453 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 WDR44Q5JSH3 913 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 STK32AQ8WU08 396 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 ERP27Q96DN0 273 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 SMC6Q96SB8 1091 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TBK1Q9UHD2 729 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 PTPRJQ12913 1337 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TGDSO95455 350 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 KCNA2P16389 499 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 GNA15P30679 374 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 CETN2P41208 172 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 CDKN2BP42772 138 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 WNT7BP56706 349 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 GRIK3Q13003 919 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 DNAJC3Q13217 504 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TMED2Q15363 201 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 SEPT14Q6ZU15 432 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 CHSY1Q86X52 802 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 FAM13CQ8NE31 585 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 VPS11Q9H270 941 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 POLIQ9UNA4 740 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 CLUHO75153 1309 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 A0A0G2JMZ2 1700 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 CALB1P05937 261 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 CFHP08603 1231 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 PTPN4P29074 926 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 GPX6P59796 221 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 CENPUQ71F23 418 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 H0YIN7 160 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 ACADSP16219 412 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 ABL2P42684 1182 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 ARSEP51690 589 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 SLC1A5Q15758 541 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00598-211ENST00000636621 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms