RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	IGSF8	Q969P0	613 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	USP44	Q9H0E7	712 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	EBF3	Q9H4W6	596 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	RSAD1	Q9HA92	442 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ASAH2	Q9NR71	780 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	GKN1	Q9NS71	199 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR19	A6NJB7	356 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	PRRG1	O14668	218 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP26A1	O43174	497 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	FIBP	O43427	364 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	CS	O75390	466 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPY3	P0CV98	308 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPY8	P0CW00	308 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	FOSL1	P15407	271 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ELF1	P32519	619 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1D2	P34982	312 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	EOGT	Q5NDL2	527 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	MANEA	Q5SRI9	462 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP57	Q86XR8	500 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL14	Q8N4G2	192 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	AZI2	Q9H6S1	392 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	STX8	Q9UNK0	236 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	TACC2	O95359	2948 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440		H0Y8X5	98 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R2C6	588 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	PRDM1	O75626	825 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	MBD4	O95243	580 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	PDE6A	P16499	860 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	FGFR4	P22455	802 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	GJA4	P35212	333 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT83	P78385	493 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAM9	Q13443	819 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC14A	Q86T13	490 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	BIVM	Q86UB2	503 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ALLC	Q8N6M5	410 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	TBX20	Q9UMR3	447 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	SGK1	O00141	431 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNK3	O14649	394 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	ITGAV	P06756	1048 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	CKMT2	P17540	419 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	TEAD4	Q15561	434 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	TGIF1	Q15583	401 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	XYLT1	Q86Y38	959 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	EID2	Q8N6I1	236 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	SCLT1	Q96NL6	688 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	IPP	Q9Y573	584 aa		7.09	□□□□□ -1.27
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		7.09	□□□□□ -1.27

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