RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620941.1

SRSF3-208, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SRSF3, Length 869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF3-208ENST00000620941 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 OR6C75A6NL08 312 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 OAZ2O95190 189 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 CFIP05156 583 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 XBP1P17861 261 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 PDGFRLQ15198 375 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 XKR4Q5GH76 650 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 CENPPQ6IPU0 288 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 ANO7Q6IWH7 933 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 TTC30AQ86WT1 665 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 CPA6Q8N4T0 437 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 CEP76Q8TAP6 659 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 ADAM32Q8TC27 787 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 CD101Q93033 1021 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 ACAP3Q96P50 834 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 HPS4Q9NQG7 708 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 TNFSF13BQ9Y275 285 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.65□□□□□ -0.06
SRSF3-208ENST00000620941 MAST4O15021 2626 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 LAMA5O15230 3695 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 K7ERI5 159 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 OR4Q2P0C623 313 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 CPA1P15085 419 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 KCNE1P15382 129 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 BCKDHBP21953 392 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 CYP4F8P98187 520 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 CHFRQ96EP1 664 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 TCHPQ9BT92 498 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 CACNA1EQ15878 2313 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 A0A087WWV3 80 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 GJA4P35212 333 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 NR1H3Q13133 447 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 NPY5RQ15761 445 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 RASSF3Q86WH2 238 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 FBXL16Q8N461 479 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 TDP1Q9NUW8 608 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 TBX20Q9UMR3 447 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 RAXQ9Y2V3 346 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.071e-26■■■■■ 28.5
SRSF3-208ENST00000620941 HSPA4P34932 840 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 HOXD12P35452 270 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 MYBPC2Q14324 1141 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 CALCRLQ16602 461 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 PADI6Q6TGC4 694 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 BSNDQ8WZ55 320 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 NUP205Q92621 2012 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 ECT2Q9H8V3 914 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 CNTN3Q9P232 1028 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF3-208ENST00000620941 MTMR11A4FU01 709 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms