RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 NTHL1P78549 312 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ZXDAP98168 799 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 COBLL1Q53SF7 1204 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 TOP6BLQ8N6T0 577 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ZNF516Q92618 1163 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 HSFX1Q9UBD0 423 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SNX9Q9Y5X1 595 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 MTMR11A4FU01 709 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 MAPK13O15264 365 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 KINO60870 393 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 CASP4P49662 377 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 AP3M2P53677 418 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ZCWPW2Q504Y3 356 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 TMEM31Q5JXX7 168 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 CENPPQ6IPU0 288 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 DPH6Q7L8W6 267 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 LIMS2Q7Z4I7 341 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SMARCE1Q969G3 411 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 PGLYRP2Q96PD5 576 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.75■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 PTPN2P17706 415 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SMARCB1Q12824 385 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 CRISPLD1Q9H336 500 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 CST3P01034 146 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 LAMP2P13473 410 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 NR2F2P24468 414 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 RPL13P26373 211 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 DUSP4Q13115 394 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 EDRF1Q3B7T1 1238 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SLC39A12Q504Y0 691 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ATAD1Q8NBU5 361 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 TMC2Q8TDI7 906 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ACBD6Q9BR61 282 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 IGSF9Q9P2J2 1179 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 YIPF1Q9Y548 306 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 GABRDO14764 452 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ASGR2P07307 311 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 RHOP08100 348 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 TWF1Q12792 350 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 PLD1Q13393 1074 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 MTMR3Q13615 1198 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SOWAHAQ2M3V2 549 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 CEP135Q66GS9 1140 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ELMOD1Q8N336 334 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 KCNK12Q9HB15 430 aa26.73■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 STAU1O95793 577 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 PRCPP42785 496 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 LHX1P48742 406 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 UBE2HP62256 183 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 TSPY1Q01534 308 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 UBALD2Q8IYN6 164 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ADGRF2Q8IZF7 708 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 FGF13Q92913 245 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 NXPE3Q969Y0 559 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 LRFN3Q9BTN0 628 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 CEP72Q9P209 647 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 CDH7Q9ULB5 785 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 FAM86C2PA6NEL3 165 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 PRR33A8MZF0 331 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 MYL7Q01449 175 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ENPEPQ07075 957 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 TRIM67Q6ZTA4 783 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ITFG1Q8TB96 612 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 PTPRDP23468 1912 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 IKBKBO14920 756 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 AKAP3O75969 853 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ATICP31939 592 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SIGLEC14Q08ET2 396 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ADAM9Q13443 819 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 TRPC3Q13507 836 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SLC5A9Q2M3M2 681 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 IQCEQ6IPM2 695 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 LEMD2Q8NC56 503 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SPPL2BQ8TCT7 592 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 CORO1BQ9BR76 489 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 XYLT2Q9H1B5 865 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 ZNF318Q5VUA4 2279 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 FAM163BP0C2L3 166 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 ALDH1A3P47895 512 aa26.69■■□□□ 1.86
PMS1-220ENST00000618056 EPHA5P54756 1037 aa26.69■■□□□ 1.86
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