RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 BMP15O95972 392 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 TGM1P22735 817 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 ACOT2P49753 483 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 GAS6Q14393 721 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 ITIH5Q86UX2 942 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 ASB7Q9H672 318 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 SLC38A8A6NNN8 435 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 SDHBP21912 280 aa26.98■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa26.98■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 C2CD2Q9Y426 696 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 STYXL1Q9Y6J8 313 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 SPTBN2O15020 2390 aa26.97■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 GPR158Q5T848 1215 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 ADALQ6DHV7 355 aa26.97■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 MYBPHLA2RUH7 354 aa26.96■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa26.96■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 WDR44Q5JSH3 913 aa26.96■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 TASP1Q9H6P5 420 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 IL21Q9HBE4 155 aa26.95■■□□□ 1.9
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PTPRF-216ENST00000617451 TAF6P49848 677 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
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PTPRF-216ENST00000617451 THEM5Q8N1Q8 247 aa26.94■■□□□ 1.9
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF720Q7Z2F6 126 aa26.93■■□□□ 1.9
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PTPRF-216ENST00000617451 TTC8Q8TAM2 541 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
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PTPRF-216ENST00000617451 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 CYP4F8P98187 520 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 PLCB2Q00722 1185 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRF-216ENST00000617451 DMWDQ09019 674 aa26.92■■□□□ 1.9
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