RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 DYMQ7RTS9 669 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 SFR1Q86XK3 245 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEP250Q9BV73 2442 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 TDGF1P13385 188 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCNE1P24864 410 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 GABRR2P28476 465 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 YAF2Q8IY57 180 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPC1Q9H2F5 836 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 DPP3Q9NY33 737 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 NCDNQ9UBB6 729 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 DSEQ9UL01 958 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYB561D2O14569 222 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHADO15335 359 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP1R37O75864 691 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADSSP30520 456 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 TAF6P49848 677 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 CUL4AQ13619 759 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 ITIH5Q86UX2 942 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 HVCN1Q96D96 273 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 IER2Q9BTL4 223 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHRNB1P11230 501 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATF6P18850 670 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 SOX9P48436 509 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR158Q5T848 1215 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 METTL23Q86XA0 190 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 STRA6Q9BX79 667 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 STK17AQ9UEE5 414 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 FGF19O95750 216 aa22.44■■□□□ 1.18
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TRAPPC3-208ENST00000616074 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP4F8P98187 520 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNA1Q09470 495 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 WSCD1Q658N2 575 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 MSANTD3Q96H12 275 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLIC6Q96NY7 704 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYMKA6NI61 221 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 DPYSL4O14531 572 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRAMEF12O95522 483 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCR3P51677 355 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 WNT7BP56706 349 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 RESTQ13127 1097 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 GAS6Q14393 721 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 VEPH1Q14D04 833 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 IL21Q9HBE4 155 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 OBSL1O75147 1896 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 KPNA7A9QM74 516 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 IL18RAPO95256 599 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDCP20941 246 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 SATB1Q01826 763 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP2R5DQ14738 602 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 POSTNQ15063 836 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 SV2CQ496J9 727 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDR44Q5JSH3 913 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 TTC8Q8TAM2 541 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-208ENST00000616074 GIPC2Q8TF65 315 aa22.42■■□□□ 1.18
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