RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 GALNT15Q8N3T1 639 aa12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 RNF149Q8NC42 400 aa12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 RLN3Q8WXF3 142 aa12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 ANKMY1Q9P2S6 941 aa12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TPCN1Q9ULQ1 816 aa12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 YIPF1Q9Y548 306 aa12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 HELZP42694 1942 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 DPYSL4O14531 572 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 CHMP2AO43633 222 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 GALK1P51570 392 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 NAPAP54920 295 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 PTENP60484 403 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 MBTD1Q05BQ5 628 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SART3Q15020 963 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 MAP7D1Q3KQU3 841 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 PRR16Q569H4 304 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TMTC3Q6ZXV5 915 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 GAREM2Q75VX8 874 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 RDM1Q8NG50 284 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 P2RY13Q9BPV8 354 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 PARP2Q9UGN5 583 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TAF6LQ9Y6J9 622 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa12.82□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 FAM149AA5PLN7 773 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 I3L4J1 428 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 MSH4O15457 936 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 B4GALT5O43286 388 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 NPTXRO95502 500 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 THP07101 528 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 GP1BBP13224 206 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 IL12RB1P42701 662 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 CCR10P46092 362 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TLE3Q04726 772 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TRIM68Q6AZZ1 485 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SLC27A1Q6PCB7 646 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 RABEPKQ7Z6M1 372 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 FERMT3Q86UX7 667 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SPATA18Q8TC71 538 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 USP33Q8TEY7 942 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TMEM143Q96AN5 459 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SPACA7Q96KW9 195 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 RIT2Q99578 217 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 IL25Q9H293 177 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 EBF3Q9H4W6 596 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 IL17BQ9UHF5 180 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 MAFFQ9ULX9 164 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa12.81□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 ADAMTS3O15072 1205 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 EDIL3O43854 480 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 B3GAT3O94766 335 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 VNN2O95498 520 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 PTMAP06454 111 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 HLA-EP13747 358 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 RXRAP19793 462 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 BRCC3P46736 316 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TRDNQ13061 729 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TERF2Q15554 542 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 CRY1Q16526 586 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 PKDCCQ504Y2 493 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 RIN3Q8TB24 985 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SLC7A3Q8WY07 619 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SLC5A5Q92911 643 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 NXPE2Q96DL1 559 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 GKN1Q9NS71 199 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 FAM53CQ9NYF3 392 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 FBXL5Q9UKA1 691 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 MMP17Q9ULZ9 603 aa12.8□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GUA9 196 aa12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 ANTXRLA6NF34 631 aa12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 SYPP08247 313 aa12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 CYP21A2P08686 494 aa12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 ARSAP15289 507 aa12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 GJA4P35212 333 aa12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 NPEPPSP55786 919 aa12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 RHDQ02161 417 aa12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 UPP1Q16831 310 aa12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
HCG18-241ENST00000602290 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms