RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.46□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.46□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.46□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.46□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.46□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.46□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PTPRBP23467 1997 aa8.46□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PDXKO00764 312 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 OGTO15294 1046 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 INPPL1O15357 1258 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 KLRC4O43908 158 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R37O75864 691 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PRR29P0C7W0 189 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ITGA4P13612 1032 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FGFR4P22455 802 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CNR2P34972 360 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CA8P35219 290 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC63Q05C16 580 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 MCL1Q07820 350 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 EHHADHQ08426 723 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ADCY1Q08828 1119 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 MYBPC2Q14324 1141 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CAMK4Q16566 473 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 AMHR2Q16671 573 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CD302Q8IX05 232 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 RNF169Q8NCN4 708 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CPB2Q96IY4 423 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NELL2Q99435 816 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 POLD4Q9HCU8 107 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ANO10Q9NW15 660 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 STK39Q9UEW8 545 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 VWA8A3KMH1 1905 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 K7ESF4 209 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 B4GALT3O60512 393 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 EPN2O95208 641 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 NPTXRO95502 500 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CAVIN2O95810 425 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CLTAP09496 248 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC192P0DO97 292 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 MYBP10242 640 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PLA2G2AP14555 144 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GRM5P41594 1212 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 RAP1GAPP47736 663 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 SATB1Q01826 763 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 STK4Q13043 487 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GAS6Q14393 721 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 SURF1Q15526 300 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GPT2Q8TD30 523 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 SCFD1Q8WVM8 642 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ACAP3Q96P50 834 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 FIZ1Q96SL8 496 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 IER2Q9BTL4 223 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 STRA6Q9BX79 667 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 RSAD1Q9HA92 442 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 KLK13Q9UKR3 277 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-208ENST00000597576 A0A0B4J269 797 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms