RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592535.5

APOC1-208, Transcript of apolipoprotein C1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene APOC1, Length 430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1-208ENST00000592535 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 SLFN14P0C7P3 912 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 GJA1P17302 382 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 CMA1P23946 247 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 CLCN5P51795 746 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 EPHA5P54756 1037 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 PTPN5P54829 565 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 GPC5P78333 572 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 BFSP1Q12934 665 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 PAGE5Q96GU1 130 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 ASAH2Q9NR71 780 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 GDE1Q9NZC3 331 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 SIX4Q9UIU6 781 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.96□□□□□ -0.01
APOC1-208ENST00000592535 KLRC4O43908 158 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 MICAL2O94851 1124 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 KRT19P08727 400 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 AOC1P19801 751 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ALDH1A3P47895 512 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 EPHB3P54753 998 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PLD1Q13393 1074 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TMC8Q8IU68 726 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 LEMD2Q8NC56 503 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 LRRC3Q9BY71 257 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 INTS13Q9NVM9 706 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 L1RE1Q9UN81 338 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 HPSEQ9Y251 543 aa14.95□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 STK25O00506 426 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ECI2O75521 394 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 FCARP24071 287 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 CYP2J2P51589 502 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 NUBP1P53384 320 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 RBP5P82980 135 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SURF1Q15526 300 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TEAD2Q15562 447 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 RDH13Q8NBN7 331 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PHOX2BQ99453 314 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 HUS1O60921 280 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TNNC2P02585 160 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ATF6P18850 670 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 RFX1P22670 979 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 STK4Q13043 487 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 OSTM1Q86WC4 334 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 WDR49Q8IV35 697 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ASB16Q96NS5 453 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 EXOC1Q9NV70 894 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 USP25Q9UHP3 1055 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 OBSL1O75147 1896 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 A0A1W2PRU2 124 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 H0Y858 1186 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 SYKP43405 635 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 NDUFA8P51970 172 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 CYP24A1Q07973 514 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 GRM2Q14416 872 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 PSMD6Q15008 389 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC1-208ENST00000592535 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms