RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589419.1

CCBE1-204, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

TSL 4

Gene CCBE1, Length 587 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-204ENST00000589419 TAF3Q5VWG9 929 aa14.76□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 H2AFVQ71UI9 128 aa14.76□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.76□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.76□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.76□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ACP6Q9NPH0 428 aa14.76□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.76□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.76□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 MMEP08473 750 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 VDRP11473 427 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ITGB8P26012 769 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 NDST1P52848 882 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 PTPN14Q15678 1187 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 LRRC43Q8N309 656 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CASD1Q96PB1 797 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ISCUQ9H1K1 167 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 IL23AQ9NPF7 189 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 L1RE1Q9UN81 338 aa14.75□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 COL4A6Q14031 1691 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 NCANO14594 1321 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ANKRD62A6NC57 917 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 RCCD1A6NED2 376 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CYB561D2O14569 222 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 KIF5CO60282 957 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CAPN15O75808 1086 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 AMHP03971 560 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM253P0C7T8 217 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ODC1P11926 461 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CSF2RAP15509 400 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CENPCQ03188 943 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 PALB2Q86YC2 1186 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 TRIM11Q96F44 468 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 SENP8Q96LD8 212 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 TWNKQ96RR1 684 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 SNX25Q9H3E2 840 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 DSEQ9UL01 958 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CEP83Q9Y592 693 aa14.74□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CARNS1A5YM72 827 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 M0QZQ0 153 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 GABRDO14764 452 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 B3GAT3O94766 335 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 DDHD2O94830 711 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CYP11A1P05108 521 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CD19P15391 556 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 TYMPP19971 482 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 LHX1P48742 406 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 NOMO3P69849 1222 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 TCEAL1Q15170 157 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF394Q53GI3 561 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 SGO2Q562F6 1265 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 TNIP3Q96KP6 325 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 SUSD3Q96L08 255 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 LHX5Q9H2C1 402 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.73□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 A0A0U1RQJ8 604 aa14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 A8MXQ7 604 aa14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 O00370 1275 aa14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 B4GALT3O60512 393 aa14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 DGKIO75912 1065 aa14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 KIF4AO95239 1232 aa14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 MYBL1P10243 752 aa14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCBE1-204ENST00000589419 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms