RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 CD19P15391 556 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CALCOCO2Q13137 446 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MAMLD1Q13495 774 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MTMR3Q13615 1198 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PSMD6Q15008 389 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ZNF606Q8WXB4 792 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 AAASQ9NRG9 546 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 HOMER3Q9NSC5 361 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 BANF1O75531 89 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 NEFHP12036 1026 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 GCNT1Q02742 428 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CPLX4Q7Z7G2 160 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 TFAP2BQ92481 460 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 TIPINQ9BVW5 301 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 UVRAGQ9P2Y5 699 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 A0A0B4J269 797 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 GMNCA6NCL1 334 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 FAM187AA6NFU0 413 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 C19orf81C9J6K1 198 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ANP32DO95626 131 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 USP37Q86T82 979 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 EMC1Q8N766 993 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 RMI1Q9H9A7 625 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 NOD2Q9HC29 1040 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MAPK13O15264 365 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 RIPK2O43353 540 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SMIM24O75264 130 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 IFNB1P01574 187 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PAX3P23760 479 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 NOMO3P69849 1222 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 OGDHQ02218 1023 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MON1BQ7L1V2 547 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 GDAP1Q8TB36 358 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SSC5DA1L4H1 1573 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CLTAP09496 248 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ARL2P36404 184 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 HADHBP55084 474 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PLCB3Q01970 1234 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ABRAQ8N0Z2 381 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SPATC1LQ9H0A9 340 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ZWILCHQ9H900 591 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PASKQ96RG2 1323 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CDHR1Q96JP9 859 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 VPS33BQ9H267 617 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 RASGRF2O14827 1237 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 GH1P01241 217 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 IQCF3P0C7M6 154 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 LBX2Q6XYB7 198 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CYP4X1Q8N118 509 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 TCP11Q8WWU5 503 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 TSC22D3Q99576 134 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 C17orf75Q9HAS0 396 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MAP3K6O95382 1288 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 FAM107AO95990 144 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 LINGO3P0C6S8 592 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 SETSIPP0DME0 302 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CXCL8P10145 99 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CYP2C8P10632 490 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 NAMPTP43490 491 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 RAB6CQ53S08 254 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 RDM1Q8NG50 284 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 OSBPL7Q9BZF2 842 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 ADAM7Q9H2U9 754 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 CISHQ9NSE2 258 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 PCSK1NQ9UHG2 260 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-205ENST00000587860 WDR81Q562E7 1941 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms