RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-217	ENST00000583667	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667		R4GN57	208 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	PJA2	O43164	708 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	B4GALT5	O43286	388 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	TNNI1	P19237	187 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	AOC1	P19801	751 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	ARHGAP25	P42331	645 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	KIF11	P52732	1056 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	TERF1	P54274	439 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	MFAP3	P55082	362 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	SPA17	Q15506	151 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	SLC18A3	Q16572	532 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	SERINC5	Q86VE9	423 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	FLCN	Q8NFG4	579 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	SHC3	Q92529	594 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	NT5C1B	Q96P26	610 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	SYT11	Q9BT88	431 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	TLE6	Q9H808	572 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	NENF	Q9UMX5	172 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	EVPL	Q92817	2033 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF263	O14978	683 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	PER2	O15055	1255 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	AKR1B10	O60218	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	ERLIN2	O94905	339 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	NPR3	P17342	541 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	GRM5	P41594	1212 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	VAV2	P52735	878 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	WNT7B	P56706	349 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	GJB7	Q6PEY0	223 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	POF1B	Q8WVV4	589 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	TAF4B	Q92750	862 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	DESI2	Q9BSY9	194 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	DERA	Q9Y315	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	KAT6A	Q92794	2004 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	CAND2	O75155	1236 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	VNN1	O95497	513 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	HLA-DRA	P01903	254 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	STAG3L1	P0CL83	205 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	TNFSF9	P41273	254 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	PTK2	Q05397	1052 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	WDR44	Q5JSH3	913 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	NOTUM	Q6P988	496 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	VPS36	Q86VN1	386 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	KIF18A	Q8NI77	898 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	INTU	Q9ULD6	942 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	C2CD2	Q9Y426	696 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	NR2E1	Q9Y466	385 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-217	ENST00000583667	PTPRJ	Q12913	1337 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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