RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-210ENST00000580799 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.15□□□□□ -0.62
GGA3-210ENST00000580799 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.15□□□□□ -0.62
GGA3-210ENST00000580799 ATXN3LQ9H3M9 355 aa11.15□□□□□ -0.62
GGA3-210ENST00000580799 SEMA4GQ9NTN9 838 aa11.15□□□□□ -0.62
GGA3-210ENST00000580799 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GGA3-210ENST00000580799 DSEQ9UL01 958 aa11.15□□□□□ -0.62
GGA3-210ENST00000580799 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.15□□□□□ -0.62
GGA3-210ENST00000580799 DERAQ9Y315 318 aa11.15□□□□□ -0.62
GGA3-210ENST00000580799 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GGA3-210ENST00000580799 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 K7ESF4 209 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 HRO43593 1189 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CYP11A1P05108 521 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CDC25CP30307 473 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 SOX9P48436 509 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 FNTBP49356 437 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 ZNF131P52739 623 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CCINQ13939 588 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 PTPAQ15257 358 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 GPR158Q5T848 1215 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 JADE1Q6IE81 842 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 Q6ZS52 159 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CALML4Q96GE6 196 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 GCNAQ96QF7 691 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 PLIN2Q99541 437 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 MSTO1Q9BUK6 570 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 ASB7Q9H672 318 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 TASP1Q9H6P5 420 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 PARVGQ9HBI0 331 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 EPG5Q9HCE0 2579 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 ANO9A1A5B4 782 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 K7ENM7 598 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 PIRO00625 290 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 PPEF2O14830 753 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 TRAK2O60296 914 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 FAM13AO94988 1023 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 ADRB1P08588 477 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 MCM2P49736 904 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 GUCY2FP51841 1108 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 TAF12Q16514 161 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CEP68Q76N32 757 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 GPBP1Q86WP2 473 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 METTL23Q86XA0 190 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 THEM5Q8N1Q8 247 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 TMEM130Q8N3G9 435 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 MYCT1Q8N699 235 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 OR10T2Q8NGX3 314 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 FAM212AQ96EL1 285 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 LRRC3BQ96PB8 259 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 KIF2CQ99661 725 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 C2CD2Q9Y426 696 aa11.13□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 ANK1P16157 1881 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 SOBPA7XYQ1 873 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 SOAT2O75908 522 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 PRAMEF12O95522 483 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 NFICP08651 508 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 ATF6P18850 670 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 UBA7P41226 1012 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 GTF2BQ00403 316 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 DMWDQ09019 674 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 PON2Q15165 354 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 SLC39A12Q504Y0 691 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 PPM1JQ5JR12 505 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 WDR44Q5JSH3 913 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 LOXL4Q96JB6 756 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 TMEM209Q96SK2 561 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 IL21Q9HBE4 155 aa11.12□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 H3BQV1 296 aa11.11□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 CYB561D2O14569 222 aa11.11□□□□□ -0.63
GGA3-210ENST00000580799 ATG13O75143 517 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms