RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRKCEQ02156 737 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 COASYQ13057 564 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 SEZ6Q53EL9 994 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRCH2Q5VUJ6 765 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 GALNT17Q6IS24 598 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 EFCAB12Q6NXP0 572 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 MOXD1Q6UVY6 613 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 REC114Q7Z4M0 266 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZAR1Q86SH2 424 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 BLIDQ8IZY5 108 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRRC71Q8N4P6 559 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 EFHBQ8N7U6 833 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 ETNPPLQ8TBG4 499 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 TBCKQ8TEA7 893 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 GJA10Q969M2 543 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 CEP89Q96ST8 783 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAP7D2Q96T17 732 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 CWH43Q9H720 699 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 NRBP2Q9NSY0 501 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLEC1BQ9P126 229 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 CD207Q9UJ71 328 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC8-202ENST00000577426 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 FSD2A1L4K1 749 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 CPLX1O14810 134 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 CHMP2AO43633 222 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 ADAM23O75077 832 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 FGF18O76093 207 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 CSPG5O95196 566 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 DARSP14868 501 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 LAG3P18627 525 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 ADMP35318 185 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 NRIP1P48552 1158 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 NDUFV1P49821 464 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 ERVFC1P60507 584 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 CYP27A1Q02318 531 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDK5R2Q13319 367 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 DRP2Q13474 957 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 KCNC3Q14003 757 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLUL1Q15846 466 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 DUSP6Q16828 381 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRRC55Q6ZSA7 311 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 MIER3Q7Z3K6 550 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 ECHDC2Q86YB7 292 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 RUBCNQ92622 972 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 ASIC4Q96FT7 647 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 AIFM3Q96NN9 605 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 CASD1Q96PB1 797 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRRC3Q9BY71 257 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 FOXQ1Q9C009 403 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM117Q9H0C3 514 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 TLE6Q9H808 572 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 AKT3Q9Y243 479 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 LZTS1Q9Y250 596 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 STK36Q9NRP7 1315 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPTBN2O15020 2390 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 TECTAO75443 2155 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 A0A0U1RQF3 1178 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM150BA6NC51 233 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 LOC730098B7Z3J9 87 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC37A4O43826 429 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 PFKFB2O60825 505 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAFO75444 373 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDKL5O76039 1030 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRIG2O94898 1065 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 EOMESO95936 686 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 F13BP05160 661 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC8-202ENST00000577426 FGFR4P22455 802 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms