RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570063.5

RSRP1-222, Transcript of arginine and serine rich protein 1, human

TSL 5

Gene RSRP1, Length 1,821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RSRP1-222	ENST00000570063	ARL8A	Q96BM9	186 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	SCLT1	Q96NL6	688 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	ACAP3	Q96P50	834 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	PLVAP	Q9BX97	442 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063		H0YGN5	161 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	HAS3	O00219	553 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	CILP	O75339	1184 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	OGDH	Q02218	1023 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	TLK2	Q86UE8	772 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	SLCO2A1	Q92959	643 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	LRRC45	Q96CN5	670 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	NFS1	Q9Y697	457 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	NRCAM	Q92823	1304 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RSRP1-222	ENST00000570063	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	PODXL	O00592	558 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	KRT14	P02533	472 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	KCNJ1	P48048	391 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	MFSD10	Q14728	455 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	LLGL1	Q15334	1064 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	ERICH1	Q86X53	443 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	C3orf20	Q8ND61	904 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	HPDL	Q96IR7	371 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	DPP3	Q9NY33	737 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	PLAA	Q9Y263	795 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	SNX24	Q9Y343	169 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	KAT6A	Q92794	2004 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	MED7	O43513	233 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	PPFIA2	O75334	1257 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	NPTXR	O95502	500 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	TCF4	P15884	667 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	ORC1	Q13415	861 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	MCEE	Q96PE7	176 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	RUFY1	Q96T51	708 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	GJD2	Q9UKL4	321 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	CD19	P15391	556 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	PSEN2	P49810	448 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	RBP5	P82980	135 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	CDC42EP1	Q00587	391 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	TAP1	Q03518	808 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	INCA1	Q0VD86	236 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	SGO2	Q562F6	1265 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	EXD1	Q8NHP7	514 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	FMO2	Q99518	471 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	CHST7	Q9NS84	486 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	CEP83	Q9Y592	693 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	CIT	O14578	2027 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	RALA	P11233	206 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	CYP2C9	P11712	490 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RSRP1-222	ENST00000570063	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61

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