RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	BPIFB4	P59827	614 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	FAM26D	Q5JW98	314 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	FAM228A	Q86W67	206 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF677	Q86XU0	584 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	NME8	Q8N427	588 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	UBR7	Q8N806	425 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ALG3	Q92685	438 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	GDF3	Q9NR23	364 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	RAD51C	O43502	376 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ITGA4	P13612	1032 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	COMT	P21964	271 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PHKA2	P46019	1235 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	SURF1	Q15526	300 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	FAM187B	Q17R55	369 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF365	Q70YC5	407 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CEP120	Q8N960	986 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	KRT35	Q92764	455 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CDT1	Q9H211	546 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CARD9	Q9H257	536 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PTPRS	Q13332	1948 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF132	P52740	706 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MYL6	P60660	151 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MESD	Q14696	234 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	AMHR2	Q16671	573 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM270	Q6UE05	265 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CD101	Q93033	1021 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	BTBD6	Q96KE9	485 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	GDF15	Q99988	308 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CEP290	O15078	2479 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC188	H7C350	402 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	KRIT1	O00522	736 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MGEA5	O60502	916 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CAND2	O75155	1236 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	FGG	P02679	453 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CFH	P08603	1231 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	OSTN	P61366	133 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	GUCY2D	Q02846	1103 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CENPC	Q03188	943 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	NAA35	Q5VZE5	725 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	IFT20	Q8IY31	132 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM192	Q8IY95	271 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	IL23A	Q9NPF7	189 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CLSTN1	O94985	981 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CXCL10	P02778	98 aa		10.79	□□□□□ -0.68

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