RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564718.1

E2F4-204, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 3

Gene E2F4, Length 688 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-204	ENST00000564718	ALDH1A3	P47895	512 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ALCAM	Q13740	583 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	GRM2	Q14416	872 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	STK38	Q15208	465 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	NCAN	O14594	1321 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	SCN1A	P35498	2009 aa		13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	FRYL	O94915	3013 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718		A0A1W2PRU2	124 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ARNTL	O00327	626 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	IRF7	Q92985	503 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.62	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	EXTL3	O43909	919 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	YEATS4	O95619	227 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ATF6	P18850	670 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	GDI1	P31150	447 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	CDR1	P51861	262 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	IL21	Q9HBE4	155 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718		R4GN57	208 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ANK1	P16157	1881 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	CUTA	O60888	179 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ITGB3	P05106	788 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	WEE1	P30291	646 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	PNPLA4	P41247	253 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	MAGEA9	P43362	315 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	SV2C	Q496J9	727 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	NELL1	Q92832	810 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.6	□□□□□ -0.23
E2F4-204	ENST00000564718	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms