RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NR1D1P20393 614 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CALCOCO2Q13137 446 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRIK4Q16099 956 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DGKDQ16760 1214 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JADE1Q6IE81 842 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM192Q8IY95 271 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ART4Q93070 314 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCLT1Q96NL6 688 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TINF2Q9BSI4 451 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCLK3Q9C098 648 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WHRNQ9P202 907 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLIQ9UNA4 740 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USTQ9Y2C2 406 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANK1P16157 1881 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MMP3P08254 477 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMPD1P17405 629 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IRAK1P51617 712 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAS2R40P59535 323 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACVR2BQ13705 512 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC31Q6UY01 552 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CROCCP2Q86T23 111 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TFAP2BQ92481 460 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUDT17P0C025 328 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CD19P15391 556 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNJ1P48048 391 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GNGT1P63211 74 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDC42EP1Q00587 391 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPRYD7Q5W111 196 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HOOK3Q86VS8 718 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C3orf20Q8ND61 904 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATL2Q8NHH9 583 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPB2Q96IY4 423 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSPAN1O60635 241 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITGB3P05106 788 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RALAP11233 206 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT17Q04695 432 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTK6Q13882 451 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCNG2Q16589 344 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DENND2CQ68D51 928 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTC39CQ8N584 583 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACAP3Q96P50 834 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MCEEQ96PE7 176 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C2CD2Q9Y426 696 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITIH2P19823 946 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CENPHQ9H3R5 247 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EVPLQ92817 2033 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAD23BP54727 409 aa22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COPS2P61201 443 aa22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAV1Q03135 178 aa22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNX1Q13596 522 aa22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHST7Q9NS84 486 aa22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A1B0GUA9 196 aa22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RBP5P82980 135 aa22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LMNB2Q03252 620 aa22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IRF5Q13568 498 aa22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ODF2Q5BJF6 829 aa22.58■■□□□ 1.21
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms