RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-210ENST00000560934 TMX3Q96JJ7 454 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 LANCL2Q9NS86 450 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 TDP1Q9NUW8 608 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 HYPKQ9NX55 129 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 KCPQ6ZWJ8 1503 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ITGB4P16144 1822 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 BRWD3Q6RI45 1802 aa5.46□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 KDM3BQ7LBC6 1761 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 PI4KAP2A4QPH2 592 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 RAD17O75943 681 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ITGB3P05106 788 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 RAP2AP10114 183 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 PCSK1P29120 753 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 CRKLP46109 303 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 NFIXQ14938 502 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 PGS1Q32NB8 556 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 FAM47AQ5JRC9 791 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 NXNQ6DKJ4 435 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 D2HGDHQ8N465 521 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 TMEM57Q8N5G2 664 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 EXOC6Q8TAG9 804 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 AIFM3Q96NN9 605 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 MAP3K14Q99558 947 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 TMEM140Q9NV12 185 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 DTNBO60941 627 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 GPR32O75388 356 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 DDCP20711 480 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 GUCY1A2P33402 732 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 EIF5P55010 431 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 CDC42EP1Q00587 391 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 PLP2Q04941 152 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ICAM4Q14773 271 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 AFMIDQ63HM1 303 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 KSR2Q6VAB6 950 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 DEFB132Q7Z7B7 95 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 TTC7BQ86TV6 843 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 Q8TCH9 128 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 LOXL4Q96JB6 756 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 MYOCQ99972 504 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 KCNH6Q9H252 994 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 PTPRCP08575 1304 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 KIF16BQ96L93 1317 aa5.44□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 DOT1LQ8TEK3 1739 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 VSTM5A8MXK1 200 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ZNF623O75123 536 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 RPS6KA4O75676 772 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ALDH2P05091 517 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ALDH1A3P47895 512 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 FLT3LGP49771 235 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 CTSWP56202 376 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 ATP8B2P98198 1209 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 SP140Q13342 867 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 MTM1Q13496 603 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 HLFQ16534 295 aa5.43□□□□□ -1.54
LINS1-210ENST00000560934 BEND3Q5T5X7 828 aa5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms