RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PATJQ8NI35 1801 aa21.03■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PRU2 124 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAK2O60296 914 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAT6P42226 847 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GUCY2FP51841 1108 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCM6Q14566 821 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP49Q70CQ1 688 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMC8Q8IU68 726 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YAF2Q8IY57 180 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC15Q8TF66 581 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MSANTD3Q96H12 275 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SENP8Q96LD8 212 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLIC6Q96NY7 704 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 K7ENM7 598 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARNTLO00327 626 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHADO15335 359 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGF19O95750 216 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ODC1P11926 461 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SV2BQ7L1I2 683 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM212AQ96EL1 285 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DERAQ9Y315 318 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTMR11A4FU01 709 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPEF2O14830 753 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CUTAO60888 179 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHRNB1P11230 501 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TDGF1P13385 188 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SDHBP21912 280 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCNE1P24864 410 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCR3P51677 355 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GTF2BQ00403 316 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FCHO2Q0JRZ9 810 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9orf57Q5W0N0 161 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 JADE1Q6IE81 842 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMG2Q969U7 264 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHAMP1Q96JM3 812 aa21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIRO00625 290 aa20.99■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP11A1P05108 521 aa20.99■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.99■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITIH5Q86UX2 942 aa20.99■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.99■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.99■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASB7Q9H672 318 aa20.99■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCANO14594 1321 aa20.99■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANO9A1A5B4 782 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CXCL12P48061 93 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ME1P48163 572 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAREM2Q75VX8 874 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM209Q96SK2 561 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FIZ1Q96SL8 496 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DSEQ9UL01 958 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPYSL4O14531 572 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NFICP08651 508 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACOT2P49753 483 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT85P78386 507 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGAP8P85298 464 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC32Q14392 662 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADALQ6DHV7 355 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CUEDC2Q9H467 287 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OBP2AQ9NY56 170 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB23Q9ULC3 237 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C2CD2Q9Y426 696 aa20.97■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.96■□□□□ 0.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAP43P17677 238 aa20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms