RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 SKAP1Q86WV1 359 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 FBXL16Q8N461 479 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 DEPTORQ8TB45 409 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 KCNB2Q92953 911 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PSMG2Q969U7 264 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TASP1Q9H6P5 420 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 OBSL1O75147 1896 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PI4KAP42356 2102 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PRB1P04280 392 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 KCNE1P15382 129 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ENGP17813 658 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 WEE1P30291 646 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 NAMPTP43490 491 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 EVCP57679 992 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 CRELD1Q96HD1 420 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 SLC32A1Q9H598 525 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ANK1P16157 1881 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 MTMR11A4FU01 709 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 MED24O75448 989 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 OAZ2O95190 189 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 DRD1P21728 446 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 GJA4P35212 333 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PTGER3P43115 390 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ALDH1A3P47895 512 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PLD1Q13393 1074 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ANO7Q6IWH7 933 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 APPL2Q8NEU8 664 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 MDM1Q8TC05 714 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 RLN3Q8WXF3 142 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 CNTN3Q9P232 1028 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TBX20Q9UMR3 447 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TNFSF13BQ9Y275 285 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 RAXQ9Y2V3 346 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 APC2O95996 2303 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PCDH15Q96QU1 1955 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 KALRNO60229 2985 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TSC2P49815 1807 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 M0QZQ0 153 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ABLIM1O14639 778 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 LARGE1O95461 756 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ATF6P18850 670 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TXKP42681 527 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PSMD2Q13200 908 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 GPR17Q13304 367 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 SEZ6Q53EL9 994 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PADI6Q6TGC4 694 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 RASSF3Q86WH2 238 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 FNBP1Q96RU3 617 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 CYP11B2P19099 503 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 SPAG1Q07617 926 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 LMAN2Q12907 356 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 NR5A1Q13285 461 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PTPAQ15257 358 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms