RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NPTXRO95502 500 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SLC10A3P09131 477 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 HOXC6P09630 235 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 VDRP11473 427 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CYP11B1P15538 503 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CHRNB2P17787 502 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ABCB4P21439 1286 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TNFSF9P41273 254 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PDE6CP51160 858 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TNFAIP2Q03169 654 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 XRCC4Q13426 336 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 MYBPC3Q14896 1274 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SURF1Q15526 300 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 GRIK4Q16099 956 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 FAM187BQ17R55 369 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SEZ6Q53EL9 994 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ARMC3Q5W041 872 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 C17orf99Q6UX52 265 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 LCA5Q86VQ0 697 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 FAM228AQ86W67 206 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PALB2Q86YC2 1186 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 WDR49Q8IV35 697 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RFFLQ8WZ73 363 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RUBCNQ92622 972 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PSMB7Q99436 277 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ISCUQ9H1K1 167 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RNF14Q9UBS8 474 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TMCO1Q9UM00 188 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 AKT3Q9Y243 479 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 EVPLQ92817 2033 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CES2O00748 559 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 B4GALT5O43286 388 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ADCY6O43306 1168 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PHACTR2O75167 634 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 MMEP08473 750 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 GZMAP12544 262 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 KRT5P13647 590 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 IDO1P14902 403 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CXCR5P32302 372 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PAFAH1B1P43034 410 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PSMC4P43686 418 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PSMD7P51665 324 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 FMO1Q01740 532 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CDR2Q01850 454 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ITIH3Q06033 890 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CUL2Q13617 745 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NCOA4Q13772 614 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RPS6KA1Q15418 735 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 EMC10Q5UCC4 262 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NME8Q8N427 588 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 USP6NLQ92738 828 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 THAP2Q9H0W7 228 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CDT1Q9H211 546 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ACP6Q9NPH0 428 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 A0A087WZ62 844 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TMEM221A6NGB7 291 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NDUFAB1O14561 156 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CEP104O60308 925 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 KIF4AO95239 1232 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 VTNP04004 478 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CLTAP09496 248 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 LINGO3P0C6S8 592 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RHOXF2BP0C7M4 288 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 IQCF3P0C7M6 154 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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