RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543185.5

HDAC4-215, Transcript of histone deacetylase 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HDAC4, Length 8,990 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4-215ENST00000543185 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.18■□□□□ 0.82
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HDAC4-215ENST00000543185 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 GREM2Q9H772 168 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 SYTL3Q4VX76 610 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 BBOX1O75936 387 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 PTPN21Q16825 1174 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 MICALL2Q8IY33 904 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.18■□□□□ 0.82
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HDAC4-215ENST00000543185 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 EMSYQ7Z589 1322 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.17■□□□□ 0.82
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HDAC4-215ENST00000543185 POTECB2RU33 542 aa20.17■□□□□ 0.82
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HDAC4-215ENST00000543185 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 ENKURQ8TC29 256 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 ABCB11O95342 1321 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 ZNF862O60290 1169 aa20.16■□□□□ 0.82
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HDAC4-215ENST00000543185 AFG1LQ8WV93 481 aa20.16■□□□□ 0.82
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HDAC4-215ENST00000543185 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.16■□□□□ 0.82
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HDAC4-215ENST00000543185 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 CCT8P50990 548 aa20.15■□□□□ 0.82
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HDAC4-215ENST00000543185 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 FDFT1P37268 417 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 RGS2P41220 211 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 TIMM44O43615 452 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 MAGEA4P43358 317 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC4-215ENST00000543185 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.15■□□□□ 0.82
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