RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC14L1Q92503 715 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB17Q9H0T7 212 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 RRM1P23921 792 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 RWDD2BP57060 319 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 DR1Q01658 176 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MON1BQ7L1V2 547 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM114A2Q9NRY5 505 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 THAP12O43422 761 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 NPTXRO95502 500 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PYGMP11217 842 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MYL6P60660 151 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP58Q5T655 872 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 LHX8Q68G74 356 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 AADACL2Q6P093 401 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 UBR7Q8N806 425 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SH3GL2Q99962 352 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PLVAPQ9BX97 442 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TNNC2P02585 160 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 NFICP08651 508 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ECHS1P30084 290 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC1A1P43005 524 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF132P52740 706 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 NOMO3P69849 1222 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SESTD1Q86VW0 696 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM187AA6NFU0 413 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8KD6RF30 607 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO1FO00160 1098 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 DAPK3O43293 454 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PHF2O75151 1096 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 IL18RAPO95256 599 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CHRNA3P32297 505 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 JADE1Q6IE81 842 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SERINC5Q86VE9 423 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PASD1Q8IV76 773 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 IQCKQ8N0W5 287 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SLAIN1Q8ND83 568 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 GRK4P32298 578 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 GRM5P41594 1212 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC45Q96CN5 670 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ZIM3Q96PE6 472 aa21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CFHP08603 1231 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 LMAN1P49257 510 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF180Q86T96 592 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SNTG2Q9NY99 539 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM17Q9Y577 477 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6CA6NDK9 693 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ACLYP53396 1101 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF699Q32M78 642 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 NOTUMQ6P988 496 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM228AQ86W67 206 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PRELID2Q8N945 189 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CXorf38Q8TB03 319 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ACAP3Q96P50 834 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ERP44Q9BS26 406 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SIX4Q9UIU6 781 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 HES2Q9Y543 173 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 SCINQ9Y6U3 715 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CHRNA1P02708 482 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-211ENST00000539589 KYAT1Q16773 422 aa21.5■■□□□ 1.03
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