RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 PDE6CP51160 858 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 RAD23BP54727 409 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 TNNC1P63316 161 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 VPS36Q86VN1 386 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 C3orf58Q8NDZ4 430 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 TFAP2BQ92481 460 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 CILPO75339 1184 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 BPIFB4P59827 614 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 LIMS2Q7Z4I7 341 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 GDAP2Q9NXN4 497 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 PJA2O43164 708 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 P4HA1P13674 534 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 GNA15P30679 374 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 TAF6P49848 677 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 CD300LGQ6UXG3 332 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC4A11Q8NBS3 891 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 TNNT1P13805 278 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 GATMP50440 423 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 INCA1Q0VD86 236 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 SHHQ15465 462 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 UPP1Q16831 310 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 PODXLO00592 558 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 HCRTO43612 131 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 DDHD2O94830 711 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 BRD2P25440 801 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 NDST1P52848 882 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC9A7Q96T83 725 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC3P53804 2025 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 THAP12O43422 761 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 PNPLA4P41247 253 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 GALCP54803 685 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 GRIK3Q13003 919 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 RASIP1Q5U651 963 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 TOP1MTQ969P6 601 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF560Q96MR9 790 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR24Q96S15 920 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 ISCUQ9H1K1 167 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 L1RE1Q9UN81 338 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-209ENST00000532457 F8W810 466 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 RPL9P32969 192 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF5AQ12840 1032 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF677Q86XU0 584 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 TDHQ8IZJ6 230 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM176AQ96HP8 235 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 HOXA2O43364 376 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 TUSC3Q13454 348 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 SV2CQ496J9 727 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 CASD1Q96PB1 797 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 H2AFZP0C0S5 128 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 GZMAP12544 262 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 UNGP13051 313 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 LMO2P25791 158 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 DEFB103AP81534 67 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 H2AFVQ71UI9 128 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 PASD1Q8IV76 773 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 CYB561D2O14569 222 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT86O43790 486 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 RTN2O75298 545 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 UPP2O95045 317 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 ITGB1P05556 798 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-209ENST00000532457 PAEPP09466 180 aa23.37■■□□□ 1.33
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