RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530202.1

TDRKH-215, Transcript of tudor and KH domain containing, human

TSL 3

Gene TDRKH, Length 477 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TDRKH-215	ENST00000530202	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	RAD54L	Q92698	747 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	SENP8	Q96LD8	212 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ZNF560	Q96MR9	790 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	STK17A	Q9UEE5	414 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202		A0A1W2PRU2	124 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ANO9	A1A5B4	782 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ARNTL	O00327	626 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	PIR	O00625	290 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	HOXA6	P31267	233 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	DDIT3	P35638	169 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	TXLNA	P40222	546 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	TNFSF9	P41273	254 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	TAF6	P49848	677 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ALCAM	Q13740	583 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	SV2C	Q496J9	727 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ADAL	Q6DHV7	355 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	JADE1	Q6IE81	842 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	PLIN2	Q99541	437 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	RTKN	Q9BST9	563 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CHRNB1	P11230	501 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	GAP43	P17677	238 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	PLCG1	P19174	1290 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CCNE1	P24864	410 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	VIPR2	P41587	438 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	SPTBN2	O15020	2390 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ATG13	O75143	517 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	RET	P07949	1114 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	TDGF1	P13385	188 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	GABRR2	P28476	465 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	TSPY1	Q01534	308 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	SPAG1	Q07617	926 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	MCM6	Q14566	821 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	GPR158	Q5T848	1215 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	POTEH	Q6S545	545 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	GAREM2	Q75VX8	874 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	DPP3	Q9NY33	737 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	KPNA7	A9QM74	516 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CYB561D2	O14569	222 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	VNN2	O95498	520 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	NFIC	P08651	508 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CSH1	P0DML2	217 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TDRKH-215	ENST00000530202	CSH2	P0DML3	217 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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