RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 PSMG2Q969U7 264 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRJ-205ENST00000527952 DLL3Q9NYJ7 618 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRJ-205ENST00000527952 CHADO15335 359 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC26A4O43511 780 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 DMWDQ09019 674 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 MGAT5BQ3V5L5 792 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR44Q5JSH3 913 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 TXNDC11Q6PKC3 985 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 DYMQ7RTS9 669 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 CD302Q8IX05 232 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 GIPC2Q8TF65 315 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ANO9A1A5B4 782 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 DPYSL4O14531 572 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 CYB561D2O14569 222 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 HOXC13P31276 330 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 E2F7Q96AV8 911 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 BORCS6Q96GS4 357 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 EPSTI1Q96J88 318 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 TSPAN18Q96SJ8 248 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 GTSE1Q9NYZ3 720 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 USP18Q9UMW8 372 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ASB3Q9Y575 518 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 PRAMEF12O95522 483 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 CCR3P51677 355 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 Q6ZS52 159 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRTM3Q86VH5 581 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 SFR1Q86XK3 245 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 PARD6AQ9NPB6 346 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 DPP3Q9NY33 737 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ATF6P18850 670 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 CXCL12P48061 93 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 FCHO2Q0JRZ9 810 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 WSCD1Q658N2 575 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 PRR23BQ6ZRT6 265 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 METTL23Q86XA0 190 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 C2orf42Q9NWW7 574 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 DERAQ9Y315 318 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 CLIC4Q9Y696 253 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP11A1P05108 521 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 DDIT3P35638 169 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 FNTBP49356 437 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 TAF6P49848 677 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 NRLP54845 237 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 TNK2Q07912 1038 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 PON2Q15165 354 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ITIH5Q86UX2 942 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 STKLD1Q8NE28 680 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ASB7Q9H672 318 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 IL21Q9HBE4 155 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 GMEB2Q9UKD1 530 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 NCOR2Q9Y618 2525 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 BMP15O95972 392 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 SCP2P22307 547 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 TGM1P22735 817 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 WNT7BP56706 349 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNA1Q09470 495 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 SPEM2Q0P670 501 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP2R5DQ14738 602 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 BRAPQ7Z569 592 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 POMGNT1Q8WZA1 660 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM84AQ96KN4 292 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 TASP1Q9H6P5 420 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 STYXL1Q9Y6J8 313 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 SPTBN2O15020 2390 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ATG2BQ96BY7 2078 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRJ-205ENST00000527952 ADSSP30520 456 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 CTHP32929 405 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 TUFMP49411 452 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 VEPH1Q14D04 833 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 TAF12Q16514 161 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-205ENST00000527952 MAMSTRQ6ZN01 415 aa25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms