RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 PLD1Q13393 1074 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 FZD5Q13467 585 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 POSTNQ15063 836 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 GAREM2Q75VX8 874 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 C1orf210Q8IVY1 113 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PDILTQ8N807 584 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SAAL1Q96ER3 474 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.36■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 CYB561D2O14569 222 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 IL18RAPO95256 599 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 IDEP14735 1019 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ATF6P18850 670 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 GARTP22102 1010 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 VIPR2P41587 438 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ALCAMQ13740 583 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 WSCD1Q658N2 575 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PSMG2Q969U7 264 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 CLDN23Q96B33 292 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.35■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 A0A1W2PRU2 124 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SPTLC2O15270 562 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PPP6R2O75170 966 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SP9P0CG40 484 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 HOXD13P35453 343 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 STK38Q15208 465 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 HPS3Q969F9 1004 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TNMDQ9H2S6 317 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 IL21Q9HBE4 155 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PANK4Q9NVE7 773 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 DSEQ9UL01 958 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 R4GN57 208 aa20.34■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 FAM170BA6NMN3 283 aa20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PSMC3P17980 439 aa20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 CDR1P51861 262 aa20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 EPHB3P54753 998 aa20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SHC4Q6S5L8 630 aa20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TRIM9Q9C026 710 aa20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 SIX4Q9UIU6 781 aa20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 ASB3Q9Y575 518 aa20.33■□□□□ 0.85
CTTN-211ENST00000527622 PTPRJQ12913 1337 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 KPNA7A9QM74 516 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 YEATS4O95619 227 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 ALDH1A3P47895 512 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 SV2CQ496J9 727 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 ZNF560Q96MR9 790 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 BRD9Q9H8M2 597 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 EXTL3O43909 919 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 ITGB3P05106 788 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 GDI1P31150 447 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 EHHADHQ08426 723 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 IRF7Q92985 503 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 PKMYT1Q99640 499 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 BCO2Q9BYV7 579 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 GPR88Q9GZN0 384 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 L1RE1Q9UN81 338 aa20.31■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 GABRR2P28476 465 aa20.3■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 MAGEA9P43362 315 aa20.3■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.3■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.3■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 ADSSL1Q8N142 457 aa20.3■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.3■□□□□ 0.84
CTTN-211ENST00000527622 CUEDC2Q9H467 287 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms