RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521189.1

CLVS1-207, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,532 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-207ENST00000521189 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 VPS4AQ9UN37 437 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TCHHQ07283 1943 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PRSS44E7EML9 344 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 H0Y858 1186 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TRIM77I1YAP6 450 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 MAGEB3O15480 346 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PDPK1O15530 556 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PI15O43692 258 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TOM1L1O75674 476 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PALMO75781 387 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 NUDT7P0C024 238 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SPATA31D3P0C874 917 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CCNB1P14635 433 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DRD4P21917 467 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PSMA2P25787 234 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SEC24CP53992 1094 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 MAP3K10Q02779 954 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 GRM2Q14416 872 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CCDC25Q86WR0 208 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 P3H2Q8IVL5 708 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 KCT2Q8NC54 265 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 FBXO30Q8TB52 745 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 JPH4Q96JJ6 628 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 KCNK13Q9HB14 408 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SYBUQ9NX95 663 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DACH1Q9UI36 760 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 GNPTGQ9UJJ9 305 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 POLHQ9Y253 713 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 USP20Q9Y2K6 914 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DAPK1P53355 1430 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 H7C0C1 242 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SGK1O00141 431 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ACOX3O15254 700 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DNAJB5O75953 348 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 AGR2O95994 175 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 JAK1P23458 1154 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SHMT1P34896 483 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ADH7P40394 386 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CYP4F8P98187 520 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 RHAGQ02094 409 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PLS1Q14651 629 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 OR8K3Q8NH51 312 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 UCMAQ8WVF2 138 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SLC39A7Q92504 469 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 INPP5DQ92835 1189 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 YME1L1Q96TA2 773 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 RNF38Q9H0F5 515 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TMEM60Q9H2L4 133 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 THAP9Q9H5L6 903 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ECT2Q9H8V3 914 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 STRN4Q9NRL3 753 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 WDR62O43379 1518 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 AKAP12Q02952 1782 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 IQGAP2Q13576 1575 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 IKBKBO14920 756 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms