RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 OGTO15294 1046 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 LINGO3P0C6S8 592 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ICAM3P32942 547 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 EPHB4P54760 987 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CBX3Q13185 183 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 NSMCE1Q8WV22 266 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RABEP2Q9H5N1 569 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 A6NNZ2 444 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PRLRP16471 622 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ATP4AP20648 1035 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 COMTP21964 271 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CDR2Q01850 454 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CALCOCO2Q13137 446 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 KIZQ2M2Z5 673 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TUBB8Q3ZCM7 444 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 KCTD16Q68DU8 428 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 USP38Q8NB14 1042 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MORC4Q8TE76 937 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GPR20Q99678 358 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 B4GALT5O43286 388 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CXCL8P10145 99 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 IDO1P14902 403 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 IRAK1P51617 712 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 JAM2P57087 298 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MYL6P60660 151 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PHEXP78562 749 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GHRHRQ02643 423 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ORC1Q13415 861 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CUL2Q13617 745 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 BLMHQ13867 455 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CPB2Q96IY4 423 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 INTUQ9ULD6 942 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 L1RE1Q9UN81 338 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RAD51CO43502 376 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MGRN1O60291 552 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MYL3P08590 195 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 FGFR4P22455 802 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PLTPP55058 493 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RTP1P59025 263 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ARPC4P59998 168 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SURF1Q15526 300 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RNF169Q8NCN4 708 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RAB17Q9H0T7 212 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 EBF2Q9HAK2 575 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TMCO1Q9UM00 188 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TTI1O43156 1089 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RNF40O75150 1001 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TMCC1O94876 653 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 LGALS2P05162 132 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ITGA4P13612 1032 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 P4HA1P13674 534 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 FOSL1P15407 271 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RRM1P23921 792 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PSMD6Q15008 389 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.29□□□□□ -1.08
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