RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 WACQ9BTA9 647 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANLNQ9NQW6 1124 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 DKK3Q9UBP4 350 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPEF2O14830 753 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 MOSPD3O75425 235 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 NXPH3O95157 252 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 LATS1O95835 1130 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM163BP0C2L3 166 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 CBSLP0DN79 551 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNGA1P29973 690 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 CBSP35520 551 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC16A1P53985 500 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB39AQ14964 217 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACAP2Q15057 778 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PROSER3Q2NL68 480 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR66Q8TBY9 1149 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 WASF1Q92558 559 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 RGMAQ96B86 450 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF785A8K8V0 405 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 E9PLN8 166 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 QSOX1O00391 747 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANXA1P04083 346 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNAI3P08754 354 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHRM3P20309 590 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGALP20701 1170 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD6P30203 668 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 WASP42768 502 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALDH9A1P49189 494 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNAI1P63096 354 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 POC1BQ8TC44 478 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SSH1Q8WYL5 1049 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 VKORC1Q9BQB6 163 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMOC2Q9H3U7 446 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLAMF7Q9NQ25 335 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TISP43B9A030 160 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR39O43194 453 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SGTAO43765 313 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFS2O75306 463 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS4BO75351 444 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TUBB4AP04350 444 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TKTP29401 623 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGAP25P42331 645 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERVK-21P61565 698 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL10RAQ13651 578 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 RABEP1Q15276 862 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL22Q53GT1 634 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC93Q567U6 631 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 AWAT2Q6E213 333 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP4R3AQ6IN85 833 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGM2L1Q6PCE3 622 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSD4Q8NDX1 1056 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHDC4Q8TBB5 520 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBC1D5Q92609 795 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCAMP4Q969E2 229 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM136AQ96C01 138 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 HMCESQ96FZ2 354 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSBPL9Q96SU4 736 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRD9Q9H8M2 597 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRRT4C9JH25 899 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJB5O75953 348 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 NTN1O95631 604 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDHA1P08559 390 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNHG28P0DPA3 235 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 JUPP14923 745 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TLE1Q04724 770 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAF2Q6P1X5 1199 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATL2Q8NHH9 583 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 KAT5Q92993 513 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRGPRX4Q96LA9 322 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms